##################################### # get the condor dir with examples cp -r /data/BDP1_2019/condor/ . cd condor ##################################### #### inspect files ################## #### for first example ############## cat myexec.sh cat world.txt vim first_batch.job ##################################### ######### check the condor cluster### condor_status ###################################### # now the condor submission ######### condor_submit first_batch.job ### check job status ################ condor_q condor_q -better-analyze condor_q -better-analyze < jobID > ###################################### ### inspect out files ################ cat file1out cat file2out less condor.out less condor.log less condor.error ################ now the HG example with bwa ############### ############################################################# cd hg vim align.py vim bwa_batch.job less condor.error less condor.log less condor.out cat md5.txt ###############################################################
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